https://developer.nvidia.com/deep-learning-getting-started
開発環境を構築するのに少々時間はかかってしまい、決して快適な環境とは言えませんが、極端な話、インテル^® Core™ i3 プロセッサや、これ以下の仕様の Pentium^®、Celeron^® プロセッサでも、Deep Learning 開発マシンを構築することは可能です。
そのため、第６世代 Core™ i7-6600 番台（Skylake）や、Intel^® Xeon^® Processor E3 v5 Family (Skylake、E3-12xx v5)でも、GPUは一枚しか搭載しないという条件であれば、全く問題なく Deep Learning 用のPCとして使うことが可能です。
しかしながら、最初から GPU を 2枚は搭載したいという場合や、将来、２枚に増設するかもしれないという場合は、［PCI Express レーンの最大数］が40レーンある ハイエンド・デスクトップ用プロセッサ（Core™ i7-6800K、5820K を除く） や、 Intel® Xeon® Processor E5-2600 v4 Product Family を選択してください。
GPU を 3枚、4枚 搭載したいという場合は、 Intel® Xeon® Processor E5-2600 v4 Product Family を２基搭載した DP（Dual Processor）サーバーや、100万円を軽く超えてしまう かなり高価なサーバーとなりますが、 Intel® Xeon® Processor E5-4600 v4 Product Family を４基搭載した MP（Multi Processor ）サーバーが必要となります。

※ 参考ページ
A Full Hardware Guide to Deep Learning (Tim Dettmers)

※ GPUを搭載していないけど、何とか CPUだけで Deep Learning を体験してみたいという方は、こちらを参考にしてみてください。
GPUなしのNVIDIA DIGITS3で始めるDeepLearning
ソースからのコンパイルが必要ですが、DIGITS 4.0 も、GPU無しで動作するはずです。
代表的な Deep Learning の Frameworks である Caffe も、デフォルトでは、GPU無しで動作する設定になっています。
※ インテル^® Xeon^® プロセッサや、Xeon^® Phi™ x200 プロセッサ（Knights Landing）を使用した場合の Deep Learning 開発に関しての情報はこちらをご覧ください。

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